Немного про BIG-Y (текст переведен автопереводчиком, но в основном суть его ясна):
Даты формирования SNP и TMRCA - Какое правильное количество лет?
ДНК в человеческой хромосоме состоит из около 59 миллионов пар оснований-59 млн. SNP. И это для каждого, и каждого живого сегодня.
SNP - это узнаваемая мутация, которая произошла у одного предка и передается всем его потомкам мужского пола. Генеалогически актуальные регионы - это те, которые передаются целы от отца к сыну с высокой верностью - приблизительно 23,600,000 SNP (23.6 Мбит) для последовательности.
Используя древние образцы ДНК, радиоуглеродные датировки и образцы из живых тестеров Y-ДНК, были разработаны формулы для оценки дат формирования SNP, а также для расчета времени для наиболее недавнего общего предка между двумя наборами ДНК.
После первоначального проекта проекта проекта Human Genome Project Project Human Genome, которая позволяет постепенное улучшению качества, которое стало возможным благодаря технологическим достижениям, а также улучшениям в представлении справочного генома последовательность.
В феврале 2009. года на человеке было использовано только 16,409,402 пар оснований.
FTDNA использовала hg19 для оценки Big Y (2014) и Big Y-500 (2018).
Big Y: (оригинальные и 500) результаты включали в среднем 9,312,560 звонков, и в общей сложности 16,409,402 локовиков, что привело к 130.953 лет на SNP.
YFull использует только координаты SNP, попадающих в комбинированные регионы, предназначенные для выбора сегментов X-дегенерата. Комбинированные границы зоны были сформированы путем взаимного перекрывающихся файлов BED, взятых из работы Poznik et al. (2013) (общая длина 10.45 Mbp) и обобщённым файлом BED BED (длиной 11.38 М опубликовано в Big Y White Paper (2014). Результатом стало 857 непрерывных сегментов Y-хромосомы общей длиной 8,473,821 пар основания.
В формуле YFull используется предполагаемый показатель мутации 144.41 лет (0.8178*10-9, что является средним показателем мутации древнего образца Anzick-1 и группы известных генеалогий, и предполагаемый возраст 60 лет. годы для живых провайдеров YFull образцов.
В то время как FTDNA продолжала использовать hg19 читать до 2018 года, YFull воспользовался этим, используя BIGY Raw Data, чтобы предоставить SNP Даты и Time Time Time Common Ancestor (TMRCA), используя hg38 читать с день.
Последняя сборка человеческого генома, официально названного GRCh38 (для Genome Research Consortium Consortium), но обычно по прозвищу Hg38 (для генома человека Hg38 был выпущен в декабре 2013. года.
Hg38 - это исправленная и улучшенная версия hg19. Она не является собственностью ни одной компании, но используется в Genetic Genealogy Community.
FTDNA начала использовать hg38 по своим собственным результатам BIGY в 2018. году.
Итак, теперь и FTDNA и YFull используют файлы BiG-700 Raw для интерпретации одних и тех же данных.
Большой Y-700 обычно охватывает примерно 22,500,000 пар основания или 95 %.
Алекс Уильямсон основывал дату формирования SNP на основе небольшого исследования BIGY-700 результатов R-700 от R Haplotree. Он сделал вывод, что Big Y SNP образуется примерно раз в 84.008 лет.
Итак, что правильно?
Big Y: (оригинальный и 500) звонок loci - всего 9,312,560 loci 16,409,402 130.953 ушей на SNP.
YFull (Big Y, Big Y-500 и Big Y-700) с оценкой 144.41 лет на SNP.
Big Y-700: Calloci - всего 14,516,584 22,258,838 22,258,838 с оценкой 84.008 лет на SNP, основываясь на данных из ДНК Алекса Уильямсона.
Если вы покупаете свой файл BAM от FTDNA за $ 100 и заплатите YFull еще $ 49 за анализ данных FTDNA, YFull будет использовать 144.41 лет на SNP для расчета вашего SNP путь, и оценки TMRCA.
Когда вы используете SNP трекер для просмотра SNP Path, расчеты для формирования SNP и TMRCA основаны на базе данных YFull - с использованием 144.41 лет на SNP.
Ответ лежит в части Y хромосомы, используемой при отчетности о результатах теста. Иначе вы сравниваете "яблоки с апельсинами".
Этот "фруктовый салат" создан специально. Это смесь "научных" экспериментов, манипуляций и маркетинговой стратегии.
Независимо от математики, вы можете ожидать, что близкие тесты BIGY-700 пропустят от 30 % до 40 % ваших матчей во время Modern Times.
Итак, логическое продление этого процесса заставляет меня поверить, что однажды будущий GRCh ### будет включать в себя 28,000,000 локол и приведет к оценке 42.004 лет на SNP --- а затем весь Y Chromosomosomosome будет использован для того, чтобы сократить эту оценку наполовину, и мы будем формировать SNP каждые 21.002 лет - ведь это просто простая арифметика. - И, все знают, цифры никогда не врут....
Большой Y-900-смешно.
Результати Y-DNA: Ч: I-FT89137 (BIG-Y) (ранні Європейці Палеоліта, North Dinaric cluster); ЖЧ R-BY120038 (BIG-Y, балто-слов’янська лінія); ЖЖЧ R-FT216860 (BIG-Y, балто-слов’янська лінія) + ЧЧЖЧ R-FTB79685 (BIG-Y, слов’янська лінія).
Результати mtDNA: Ж: H; ЧЖ: U5b1e1; ЧЧЖ: H2a5b1; ЖЧЖ: X2b-T226C;
Подільска губернія. Православні та старообрядці + Мглинський повіт Чернігівської губернії